Antes de la indipendencia la organización escolar en el País era escasa (aunque ya desde 1812 existiera la Universidad de León). En 1868 se realizó un proyecto de reorganización de la instrucción pública. A partir de 1912 las órdenes religiosas volvieron a fomentar la escuela. Primera y segunda enseñanza es gratuita desde 1979.

La primera enseñanza, obligatoria de forma oficial, concierne a los niños desde los 7 hasta 13 años. La segunda enseñanza se desarrolla en escuelas públicas y privadas que en 5 años forman los estudiantes para el bachillerato. Hay, además, numerosos institutos de enseñanza técnica, cuya duración varía de dos a cuatro años, y la Escuela Nacional para la Agricultura, que en tres años forma técnicos agrarios y veterinarios.

Desde hace poco se ha impulsado mucho la formación de los docentes, que dura 5 años, ya que este sector tenía lacunas considerables.

Los estudios universitarios se desarrollan en la Universidad Autónoma de Nicaragua (León 1812), en la Universidad Centro-Americana (Managua, 1961) y en el Politécnico (Managua, 1976).